Вениамин (Смирнов) родом из Архангельской епархии. Обучался в Архангельской семинарии и был там префектом, потом смотрителем уездного и приходского Архангельских духовных училищ и инспектором семинарии. По пострижении в монашество произведен игуменом в Николаевский Корельский монастырь, откуда 5 апреля 1820 года переведен в Сийский монастырь.

За время настоятельства о. Вениамина в 1824 году была упразднена деревянная Свято-Николаевская церковь при больничном корпусе и вместо нее был устроен предел во имя Святителя Николая в Благовещенской церкви. В конце 1824 г. архимандрит Вениамин был назначен начальником миссии для просвещения христианством самоедов. 2 января 1825 года он прибыл в монастырь с архимандритом Архангельского монастыря Анастасием, сдал ему монастырь в управление и отправился на миссионерское дело. С 1825 по 1830 год находился в самоедских кочевьях и был управляющим самоедской Духовной Миссии для обращения самоедов в Христианскую веру, за что награжден орденом Св. Владимира 3 степени. Находясь в тундрах, о. Вениамин свободное от проповеди время посвящал основательному изучению самоедского языка и переводу на этот язык новозаветных и других книг. В 1833 году находился в С-Петербурге на чреде священнослужения и проповеди Слова Божия, и за переведение Нового Завета на самоедский (ненецкий) язык, за составление лексикона самоедского языка и сочинение самоедской грамматики объявлено ему Высочайшее благословение. В 1839 году перемещен в Крестный монастырь Архангельской епархии, а в 1848 году переведен в Глуховский Петропавловский монастырь Черниговской епархии, где и скончался в 1850 года.