В 2012 году в Сийской обители  отмечает 20-летие возрождения монастыря. На протяжении веков это был крупный духовный центр Севера, несущий людям веру, культуру, дающий пример рачительного хозяйствования. Но в 20-х годах минувшего столетия все здесь было разорено и разрушено.
В 1992 году на территорию обители впервые вступил иеромонах Трифон (Плотников), назначенный сюда игуменом. Ему предстояло восстанавливать монастырь. Вскоре появились у него добрые помощники: послушники, трудники, благотворители.
Оглядываясь на долгий путь возрождения обители, можно сказать, что сформировано, выпестовано ядро братии, в значительной степени выстроена укладность монашеской жизни. Идет возврат к древним традициям. Братия, молодая по возрасту, духовно возрастает, обретая крепость веры, опыт молитвенного предстояния Богу, борьбы со страстями, приуготовляя души к вечной жизни.
Территория монастыря напоминает строительную площадку: в лесах Благовещенская церковь, заново построен разрушенный храм-колокольня Трех Святителей Московских Петра, Алексия и Ионы, завершены восстановительные работы и в надвратной церкви преп. Сергия Радонежского, еще много работы предстоит выполнить в главном храме обители — Троицком соборе, где почивают святые мощи преподобного Антония. Теперь уже над всеми храмами обители сияют православные кресты, и округу оглашает многоголосый звон колоколов.
Огромную помощь в возрождении монастыря оказывают различные организации и частные лица
Каждое утро в 5.30 служится братский молебен Преподобному.
Если в первые годы Божественная литургия совершалась в отдельные дни, то ныне — ежедневно. Недавно появилась новая традиция: по окончании вечернего богослужения братия и богомольцы, 150 раз читая мысленно "Богородице Дево, радуйся", обходят крестным ходом монастырские храмы с преднесением фонаря и иконы Божией Матери, которую несет старший священник.
Вторая Литургия раз в неделю служится братией на Емецком подворье обители. Совершается Божественная литургия и на подворьях в пос. Брин-Наволок, д. Ваймуга-Осередок, селе Сельцо. Регулярны молебствия в монастырской часовне прп. Антония на территории Архангельской областной клинической больницы, а также в храме в честь иконы пресвятой Богородицы "Всецарица" в областном онкологическом диспансере. Развивает свою деятельность подворье в Санкт-Петербурге — сооружен деревянный храм в честь преп. Антония Сийского.
Духовное, молитвенное делание срастворяется с деланием трудовым, хозяйственным. Монастырь имеет молочную ферму, конюшню, гараж, столярные мастерские, пекарню, тепличное и огородное хозяйство, пашни и луга.
За эти годы в обители собрана немалая библиотека. В ее основу легли современные издания богослужебных книг, житийная литература, историческая и богословская. Поступают и дореволюционные печатные издания, среди них несколько книг, ранее принадлежавших монахам Антониево-Сийского монастыря. Ныне библиотека насчитывает около 10 тысяч книг и журналов.
В сентябре 2004 года монастырю передан драгоценный дар — «Учительное Евангелие». Это рукописная книга XVI века. На последнем листе — пространная писцовая запись инока Даниила из нашего монастыря. Имя его было зашифровано тайнописью. Расшифровали специалисты из Центрального музея древнерусской культуры и искусства им. Андрея Рублева, куда дарители — москвичи Сергей и Наталья Бурдины — сдавали книгу на экспертизу. Рукопись насчитывает около 600 листов. На одном из них — заставка растительного орнамента с серебряным фоном, здесь же монохромный инициал и украшение на боковом поле. Переплет современен самой рукописи: доски в коже с тиснением. Утраты небольшие: отсутствуют несколько первых листов и застежки.
Далеко за пределами обители известна наша иконописная мастерская. Иконы пишутся для восстанавливающихся храмов монастыря и епархии.
С марта 2000 года братия издает ежемесячную газету «Духовный Сеятель». Два года назад появилось приложение к газете — «Педагогический семинар». С ноября 2001 года с некоторыми перерывами выходит церковно-исторический альманах "Сийский хронограф".
Когда-то на преподобного Феодосия, впервые подъезжавшего к Антониево-Сийскому монастырю, необыкновенно сильное духовное впечатление произвел вид Троицкого собора, белеющего летом в лесу каменными стенами, словно снег. "Бе бо тогда месяц август, и помышляше, откуда на храмех снеговидное подобие, никогда же видех, кроме поимянованныя обители каменнаго здания. Егда же врат монастырских достиже и обители благолепие узре, о, коль возрадовася духом…" И сегодня духовно радуешься при виде снеговидно сияющих храмов.
Тихими сийскими вечерами над монастырской землей, над Большим Михайловым озером разносится колокольный звон, льется плавное пение монахов. Понимаешь, какое это древнее и намоленое многими поколениями иноков святое место. Теплеет душа…